Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb1Q00420 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb1Q00420 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms