Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig3P97386 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lig3P97386 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig3P97386 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lig3P97386 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig3P97386 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig3P97386 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lig3P97386 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms