Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbx6P70327 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx6P70327 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbx6P70327 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms