Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sycp3P70281 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp3P70281 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp3P70281 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms