Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf6P70196 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf6P70196 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Traf6P70196 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf6P70196 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf6P70196 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf6P70196 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf6P70196 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf6P70196 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf6P70196 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf6P70196 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf6P70196 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf6P70196 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf6P70196 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms