Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrig1P70193 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig1P70193 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms