Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ThraP63058 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ThraP63058 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ThraP63058 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ThraP63058 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ThraP63058 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ThraP63058 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ThraP63058 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ThraP63058 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ThraP63058 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ThraP63058 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ThraP63058 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ThraP63058 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ThraP63058 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ThraP63058 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ThraP63058 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ThraP63058 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ThraP63058 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ThraP63058 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ThraP63058 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ThraP63058 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ThraP63058 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ThraP63058 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThraP63058 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThraP63058 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThraP63058 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThraP63058 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThraP63058 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThraP63058 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ThraP63058 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ThraP63058 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ThraP63058 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ThraP63058 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ThraP63058 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThraP63058 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThraP63058 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThraP63058 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThraP63058 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThraP63058 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThraP63058 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThraP63058 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ThraP63058 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ThraP63058 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThraP63058 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThraP63058 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThraP63058 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThraP63058 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThraP63058 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThraP63058 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThraP63058 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThraP63058 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThraP63058 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThraP63058 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThraP63058 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThraP63058 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThraP63058 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThraP63058 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThraP63058 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThraP63058 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ThraP63058 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThraP63058 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThraP63058 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ThraP63058 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ThraP63058 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ThraP63058 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms