Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vamp3P63024 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp3P63024 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms