Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gnb1P62874 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gnb1P62874 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gnb1P62874 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gnb1P62874 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gnb1P62874 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gnb1P62874 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gnb1P62874 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnb1P62874 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms