Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psmc6P62334 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmc6P62334 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc6P62334 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms