Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia3P60469 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia3P60469 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia3P60469 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms