Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn4P57780 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn4P57780 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn4P57780 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn4P57780 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn4P57780 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actn4P57780 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actn4P57780 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Actn4P57780 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn4P57780 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn4P57780 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms