Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsc1P55849 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsc1P55849 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsc1P55849 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms