Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb4P54761 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ephb4P54761 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb4P54761 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms