Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClgnP52194 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClgnP52194 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClgnP52194 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClgnP52194 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClgnP52194 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClgnP52194 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClgnP52194 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClgnP52194 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClgnP52194 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329.2 ms