Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn3P51791 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn3P51791 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn3P51791 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms