Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CitP49025 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CitP49025 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CitP49025 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CitP49025 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CitP49025 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CitP49025 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CitP49025 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CitP49025 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CitP49025 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CitP49025 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CitP49025 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CitP49025 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CitP49025 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CitP49025 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CitP49025 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CitP49025 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CitP49025 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CitP49025 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CitP49025 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CitP49025 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CitP49025 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CitP49025 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CitP49025 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CitP49025 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CitP49025 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CitP49025 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CitP49025 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CitP49025 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CitP49025 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CitP49025 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CitP49025 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CitP49025 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CitP49025 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CitP49025 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CitP49025 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CitP49025 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CitP49025 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CitP49025 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CitP49025 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CitP49025 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CitP49025 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CitP49025 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CitP49025 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CitP49025 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CitP49025 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CitP49025 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CitP49025 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CitP49025 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CitP49025 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CitP49025 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CitP49025 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CitP49025 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CitP49025 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CitP49025 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CitP49025 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CitP49025 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CitP49025 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CitP49025 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CitP49025 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CitP49025 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CitP49025 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CitP49025 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CitP49025 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CitP49025 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CitP49025 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CitP49025 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CitP49025 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CitP49025 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CitP49025 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CitP49025 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CitP49025 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CitP49025 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CitP49025 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CitP49025 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CitP49025 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CitP49025 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms