Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox8bP48772 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox8bP48772 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms