Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfx1P48377 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfx1P48377 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rfx1P48377 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfx1P48377 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms