Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elk3P41971 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Elk3P41971 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elk3P41971 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk3P41971 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk3P41971 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elk3P41971 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Elk3P41971 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elk3P41971 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elk3P41971 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elk3P41971 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elk3P41971 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elk3P41971 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk3P41971 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk3P41971 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elk3P41971 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms