Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab23P35288 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab23P35288 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab23P35288 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab23P35288 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab23P35288 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab23P35288 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab23P35288 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab23P35288 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab23P35288 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab23P35288 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms