Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp4P35123 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp4P35123 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp4P35123 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp4P35123 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp4P35123 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp4P35123 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms