Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OatP29758 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OatP29758 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OatP29758 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OatP29758 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OatP29758 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OatP29758 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OatP29758 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OatP29758 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OatP29758 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OatP29758 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OatP29758 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OatP29758 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OatP29758 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OatP29758 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OatP29758 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OatP29758 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OatP29758 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OatP29758 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OatP29758 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OatP29758 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OatP29758 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OatP29758 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OatP29758 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OatP29758 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OatP29758 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
OatP29758 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
OatP29758 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OatP29758 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OatP29758 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OatP29758 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OatP29758 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OatP29758 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OatP29758 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OatP29758 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OatP29758 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OatP29758 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OatP29758 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OatP29758 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OatP29758 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OatP29758 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OatP29758 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OatP29758 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OatP29758 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OatP29758 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OatP29758 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OatP29758 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OatP29758 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OatP29758 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OatP29758 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OatP29758 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OatP29758 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OatP29758 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OatP29758 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OatP29758 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OatP29758 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OatP29758 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OatP29758 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OatP29758 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OatP29758 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OatP29758 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OatP29758 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OatP29758 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OatP29758 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OatP29758 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OatP29758 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OatP29758 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OatP29758 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OatP29758 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OatP29758 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OatP29758 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OatP29758 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OatP29758 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
OatP29758 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OatP29758 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OatP29758 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OatP29758 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OatP29758 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OatP29758 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OatP29758 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
OatP29758 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OatP29758 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OatP29758 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OatP29758 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OatP29758 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OatP29758 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OatP29758 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OatP29758 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OatP29758 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OatP29758 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OatP29758 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms