Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RxraP28700 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RxraP28700 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxraP28700 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxraP28700 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RxraP28700 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxraP28700 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxraP28700 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxraP28700 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxraP28700 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RxraP28700 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxraP28700 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxraP28700 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxraP28700 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxraP28700 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxraP28700 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxraP28700 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RxraP28700 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxraP28700 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxraP28700 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxraP28700 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxraP28700 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxraP28700 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxraP28700 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxraP28700 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxraP28700 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxraP28700 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxraP28700 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxraP28700 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxraP28700 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxraP28700 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxraP28700 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxraP28700 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxraP28700 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxraP28700 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxraP28700 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxraP28700 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RxraP28700 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxraP28700 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxraP28700 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxraP28700 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxraP28700 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxraP28700 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxraP28700 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxraP28700 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxraP28700 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxraP28700 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxraP28700 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RxraP28700 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RxraP28700 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxraP28700 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxraP28700 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxraP28700 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxraP28700 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxraP28700 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxraP28700 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RxraP28700 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RxraP28700 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxraP28700 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RxraP28700 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RxraP28700 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RxraP28700 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RxraP28700 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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