Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd10P28359 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd10P28359 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd10P28359 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms