Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfraP26618 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PdgfraP26618 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfraP26618 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms