Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp53P15975 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp53P15975 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp53P15975 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp53P15975 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp53P15975 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp53P15975 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp53P15975 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp53P15975 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp53P15975 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp53P15975 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp53P15975 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp53P15975 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms