Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prph2P15499 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prph2P15499 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prph2P15499 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prph2P15499 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prph2P15499 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prph2P15499 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prph2P15499 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prph2P15499 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prph2P15499 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prph2P15499 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prph2P15499 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prph2P15499 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prph2P15499 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prph2P15499 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms