Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrphP15331 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrphP15331 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrphP15331 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrphP15331 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrphP15331 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrphP15331 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrphP15331 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrphP15331 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrphP15331 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrphP15331 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrphP15331 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrphP15331 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PrphP15331 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrphP15331 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrphP15331 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrphP15331 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrphP15331 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrphP15331 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PrphP15331 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrphP15331 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrphP15331 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrphP15331 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrphP15331 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrphP15331 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrphP15331 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PrphP15331 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrphP15331 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrphP15331 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrphP15331 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrphP15331 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrphP15331 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrphP15331 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrphP15331 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrphP15331 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrphP15331 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PrphP15331 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrphP15331 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrphP15331 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrphP15331 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrphP15331 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrphP15331 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrphP15331 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrphP15331 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrphP15331 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrphP15331 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrphP15331 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrphP15331 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrphP15331 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrphP15331 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrphP15331 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrphP15331 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrphP15331 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrphP15331 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrphP15331 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrphP15331 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrphP15331 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrphP15331 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrphP15331 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrphP15331 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrphP15331 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrphP15331 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrphP15331 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrphP15331 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrphP15331 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrphP15331 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PrphP15331 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrphP15331 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrphP15331 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrphP15331 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrphP15331 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrphP15331 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrphP15331 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrphP15331 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrphP15331 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrphP15331 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrphP15331 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrphP15331 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms