Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P10404 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P10404 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P10404 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P10404 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P10404 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P10404 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P10404 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P10404 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P10404 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P10404 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P10404 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P10404 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P10404 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P10404 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P10404 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P10404 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P10404 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P10404 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P10404 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P10404 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P10404 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P10404 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P10404 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P10404 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P10404 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P10404 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P10404 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P10404 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P10404 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P10404 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P10404 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P10404 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P10404 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P10404 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P10404 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P10404 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P10404 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P10404 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P10404 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P10404 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms