Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprqP0C5E4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprqP0C5E4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprqP0C5E4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms