Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna4P07351 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms