Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl1P05977 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl1P05977 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myl1P05977 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myl1P05977 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myl1P05977 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myl1P05977 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myl1P05977 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myl1P05977 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myl1P05977 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms