Protein–RNA interactions for Protein: P02088

Hbb-b1, Hemoglobin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-b1P02088 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-b1P02088 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-b1P02088 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-b1P02088 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms