Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01747 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01747 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01747 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01747 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01747 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01747 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01747 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01747 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01747 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01747 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01747 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01747 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01747 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01747 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01747 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01747 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01747 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01747 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01747 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01747 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01747 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01747 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01747 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01747 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01747 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01747 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01747 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01747 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01747 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01747 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01747 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01747 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01747 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01747 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01747 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01747 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01747 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01747 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01747 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01747 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01747 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01747 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01747 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01747 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01747 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01747 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01747 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01747 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01747 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms