Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01741 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01741 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01741 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01741 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01741 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01741 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01741 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01741 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01741 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01741 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01741 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01741 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01741 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01741 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01741 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01741 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01741 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01741 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01741 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01741 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01741 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01741 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01741 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01741 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01741 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01741 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01741 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01741 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01741 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01741 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01741 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01741 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01741 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01741 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01741 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01741 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01741 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01741 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01741 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01741 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01741 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms