Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01729 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01729 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01729 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01729 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01729 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01729 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01729 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01729 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01729 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01729 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01729 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01729 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01729 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01729 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01729 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01729 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01729 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01729 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01729 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01729 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01729 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01729 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01729 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01729 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01729 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01729 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01729 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01729 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01729 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01729 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01729 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01729 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms