Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01727 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01727 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
P01727 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01727 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01727 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01727 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01727 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01727 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01727 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01727 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01727 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01727 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01727 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01727 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01727 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01727 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01727 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01727 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
P01727 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01727 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01727 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01727 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01727 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01727 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01727 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01727 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01727 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P01727 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01727 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01727 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01727 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P01727 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01727 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01727 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01727 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01727 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01727 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01727 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01727 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01727 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01727 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01727 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01727 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01727 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01727 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01727 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01727 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01727 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01727 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01727 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01727 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01727 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01727 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01727 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01727 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01727 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01727 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01727 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01727 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01727 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01727 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01727 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01727 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01727 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01727 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01727 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01727 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01727 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01727 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P01727 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01727 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01727 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01727 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms