Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01672 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P01672 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01672 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01672 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01672 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01672 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01672 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01672 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01672 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01672 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01672 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01672 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
P01672 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01672 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01672 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01672 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01672 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01672 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01672 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01672 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01672 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01672 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01672 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01672 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01672 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01672 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01672 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01672 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01672 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01672 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01672 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01672 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
P01672 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01672 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01672 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01672 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01672 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01672 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01672 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01672 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01672 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01672 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01672 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P01672 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01672 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01672 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01672 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01672 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01672 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01672 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01672 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01672 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01672 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01672 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01672 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01672 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01672 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01672 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01672 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01672 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01672 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01672 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01672 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01672 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01672 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01672 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01672 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01672 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01672 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01672 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
P01672 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01672 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01672 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01672 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01672 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01672 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01672 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01672 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01672 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01672 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P01672 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01672 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms