Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gnpda1O88958 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gnpda1O88958 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gnpda1O88958 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gnpda1O88958 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms