Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba3O88888 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba3O88888 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba3O88888 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba3O88888 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apba3O88888 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apba3O88888 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Apba3O88888 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba3O88888 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba3O88888 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba3O88888 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba3O88888 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba3O88888 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba3O88888 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Apba3O88888 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Apba3O88888 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms