Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme6O88425 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme6O88425 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme6O88425 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme6O88425 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme6O88425 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme6O88425 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme6O88425 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme6O88425 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme6O88425 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms