Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm10509O88255 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm10509O88255 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm10509O88255 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10509O88255 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Gm10509O88255 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm10509O88255 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm10509O88255 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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