Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpd52l1O54818 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpd52l1O54818 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpd52l1O54818 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms