Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppfibp2O35711 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfibp2O35711 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ppfibp2O35711 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppfibp2O35711 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms