Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a2O35488 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a2O35488 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms