Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema6aO35464 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6aO35464 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6aO35464 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.5 ms