Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casq1O09165 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casq1O09165 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casq1O09165 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casq1O09165 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casq1O09165 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casq1O09165 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casq1O09165 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casq1O09165 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casq1O09165 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casq1O09165 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casq1O09165 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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