Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ebf2O08792 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ebf2O08792 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ebf2O08792 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf2O08792 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms