Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf6O08584 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf6O08584 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf6O08584 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf6O08584 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf6O08584 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf6O08584 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf6O08584 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf6O08584 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf6O08584 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf6O08584 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf6O08584 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms